Responsable de la thématique : Pr KAKOU N’DOUBA Adéle
Le nombre de decès de par le monde dus aux infections respiratoires est élevé. Parmi celle-ci, les infections respiratoire aigues touchent surtout les enfants de moins de 5 ans. Les facteurs de risque de ces infections sont représentés par une colonisation du nasopharynx par les bactéries potentiellement pathogènes et les facteurs liés à l’hôte tel l’état nutritionnel ou l’état immunitaire et mauvaises conditions socio-économiques ainsi que l’inflence saisonnière. La difficulté du diagnostic de ces infections repose sur la diversité des agents ainsi que leur technique de détention :
· Les agents viraux : a l’heure actuelle, on compte parmi les agents viraux, des génovars émergents tels les virus influenza responsable de pandémies de grippe et les coronavirus incriminés dans les syndromes aigus respiratoires sévères.
· Les agents bactériens : legionella, chlamydia, s. pneumoniae, s. aureus
· Les agents parasitaires : dans la recherche de l’étiologie des infections opportunistes dans l’infection à VIH, une place de choix devrait être apportée aux agents parasitaires et fongiques tels que histoplasma capsulatum, pneumocystis carinii.
Les grandes questions auxquelles nous essayons de répondre consernant l’identité des agents viraux, bactériens et fongiques retrouvés dans ces pathologies ainsi que des déteminants permettant d’expliquer leur pouvoir pathogène et leur èmergence.
Cette thématique se décline en deux programmes : les virus respiratoires et les virus grippaux, les bactéries et les parasites responsables d’infection respiratoires aigues.
Programme III- 1 : Virus grippaux et respiratoires
Coordonnateur : Dr Hervé KADJO
Scientifiques associés :D Coulibaly, DP. Kouassi, N.Talla Nzussouo, B Kouakou, A Ouattara, E V Adjogoua, C G Akoua-koffi, G A. Eli Aka, K Victoir, M C Dosso
Collaborations
Locales : instutut national de l’hygiène publique, côte d’ivoire
Extérieures: Sanofi Aventis-Pasteur, Côte d’Ivoire, Division Vaccin, Influenza Division, Centers for Disease Control and Prevention, Accra, Ghana, Global Disease Detection and Response Progam/US Naval Medical Research Unit-3, (NAMRU-3), Intitut pasteur de Paris, center for disease control and prevention, Nairobi, Kenya, Center for disaes Control and prevantion, Atlanta, GA, 4Global disease detection and response program/US Naval Medical Research Unit-3, (NAMRU-3).
Soutiens financiers : RIIP, DHHS, OMS, NAMRU
Contexte et justification du programme
Parmi les micro-organismes émergents, les virus respiratoires constituent actuellement un véritable problème de santé publique. La récente découverte des coronavirus apparentés au SRAS (2003 et 2012), et l’émergence de nouvelles souches de virus grippaux A (H5N1) et A ( H1N1) viennenet alourdir la problématique des infections respiratoires aigues (IRA) en Afrique et particulièrement en Afique subshaharienne. L’absence d’outil de diagnostic virologique dans bon nombre de structures sanitaires et la pauvrété de l’arsenal thérapeutique suscitent le peu d’intérèt accordé à la recherche de l’étiologie virale dans les infections respiratoires augues notamment de l’enfant compromettant ainsi son pronostic vital.
Objectifs du programme
1. Etudier du point de vue moléculaire les virus respiratoires et de la grippe
2. Etudier les facteurs de virulences liés aux virus
3. Etudier la résistance des virus vis-à-vis des molécules antivirales disponibles
4. Etudier les interactions hôte/virus
5. Etudierles bactéries et les parasites responsables d’infections respiratoires
6. Etudierles écosystèmes et les réservoirs des pathogènes respiratoires
Décomposition du programme en 2010-2011
· Virus influenza et des autres virus respiratoires en Côte d’Ivoire (2003-2010)
· Impact de la qualité des échantillons sur la PCR et l’isolement viral
· Analyse génétique des virus de la rougeole circulant en Côte d’ivoire (2003 à 2011)
· Histoplasmose chez les sujets séropositifs (VIH) consultant en milieu hospitalier dans trois villes d’Afrique subsaharienne
· Surveillance des Legionella dans les eaux de distribution, réservoirs et chauffe-eau dans les CHU d’Abidjan
Perspectives
· Surveillance des nouveaux virus (ex : nouveau Coronavirus, Arabie Saoudite) chez les pèlerins à leur retour de la Mecque
· Etudier lesvirus respiratoiresdes infections sévères
· Etudier les virus qui circulent chez les porcs
· Co-morbidités : Pathogènes respiratoires et VIH
· Caractérisation virale : Etudes des marqueurs génétiques de résistance et de virulence des virus grippaux
· Efficacité vaccinale : Etude de la séroprévalence et de l’incidence des infections respiratoires aigue chez les sujets vaccinés contre la grippe
Programme III- 2 : Bactéries des infections respiratoires
Coordonnateur : Pr KAKOU N’DOUBA Adéle
Programme III- 3 : Parasites et champignons
Coordonnateurs : Dr IRA V, Dr BOSSON VANGA Henriette
