Du 12 au 23 mai 2025, l’Institut Pasteur de Côte d’Ivoire (IPCI) a ouvert les portes de sa première session de formation régionale sur le séquençage de nouvelle génération (NGS), baptisée « De l’échantillon à la séquence et analyses bio-informatiques ». Ce programme novateur, développé par le laboratoire de génomique et métagénomique microbienne en collaboration avec le département de formation, ambitionne de renforcer les compétences en génomique au sein de la région.
La cérémonie de clôture a eu lieu à Adippodoumé le 23 mai et a réuni de nombreux participants, en présence du Directeur scientifique, le Professeur Touré Offianan. Dans son allocution, il a remercié les participants, tant de l’IPCI que d’autres institutions, y compris du Burkina Faso. Il a souligné la nécessité d’intégrer la génomique dans les pratiques de recherche actuelles, affirmant que cette formation représente un enjeu majeur pour la communauté scientifique. « Il est essentiel que vous continuiez dans cette dynamique », a-t-il encouragé.
La Professeure Gbonon Valérie, présidente du comité d’organisation, a partagé ses réflexions sur la richesse de la formation, saluant la détermination des participants. « Tout le monde s’est mobilisé comme un seul homme pour travailler », a-t-elle déclaré.
Dr. Yelemkoure T. Edwige, chercheur du Burkina Faso, a exprimé sa gratitude envers l’Institut Pasteur pour l’accueil chaleureux et la qualité des enseignements reçus. « Nous avons beaucoup appris, notamment sur l’extraction et le séquençage des bactéries, jusqu’à l’analyse et l’interprétation des données », a-t-elle précisé, reconnaissant le soutien de son institution, le Centre de Recherche Biomoléculaire Pietro Annigoni (CERBA).
Dr. Guede Kipré, chercheur à l’Unité des Antibiotiques, des substances naturelles, de la surveillance de la Résistance aux Anti-Infectieux (ASSURMI) de l’Institut Pasteur, a mis en avant la dimension pratique de la formation. Il a expliqué que les participants ont eu l’opportunité d’étudier des échantillons de pathogènes, du téléchargement des séquences à l’analyse à l’aide de l’environnement tels que Linux couplé Conda et Galaxy. « Cette expérience a été très enrichissante, notamment grâce à l’utilisation de la technologie Oxford Nanopore. La formation a renforcé notre capacité en génomique de surveillance des pathogènes multi-résistants à l’antibiothérapie dans le cadre d’une approche One Health », a-t-il conclu.
Il est important de noter que le programme de formation est organisé en trois sessions en 2025 :
Formation du 12 au 23 mai 2025
Formation du 18 au 29 août 2025
Formation du 17 au 28 novembre 2025
Les candidatures peuvent être envoyées par e-mail à l’adresse plateformegenemol@pasteur.ci, accompagnées d’un CV. Le coût de la formation est de 300 000 F CFA, avec un acompte de 50 000 F CFA à l’inscription et 250.000fcfa pour la formation . Les participants seront évalués durant la formation et recevront un certificat à la fin. Les cours seront animés par des experts reconnus dans les domaines de la biologie moléculaire et de la bio-informatique.